功能神经外科是神经外科学的一个新兴的重要分支学科，1987年中华医学会批准成立“立体定向与功能神经外科协会”，1988年《立体定向与功能神经外科杂志》创刊，1996年中华医学会批准成立“立体定向与功能神经外科专业委员会”。湖南功能神经外科发展相对滞后，湖南省第二人民医院1987年在全省率先开展立体定向手术治疗难治性精神病，经过十多年的探索和发展，于1999年底组建了功能神经外科，采用立体定向与功能神经外科手术方法治疗相关神经疾病，2004年初通过省级评审，被批准为省级重点临床学科。
　　该科率先在省内引进和开展了“细胞刀”治疗帕金森病、难治性精神病、顽固性癫痫等；视频脑电图术前癫痫灶定位和术中脑电图监测手术治疗难治性癫痫；多功能电生理刺激定位射频治疗三叉神经痛和显微血管减压手术治疗三叉神经痛、舌咽神经痛、面肌痉挛等。经过20多年的发展，已成为省内一流的临床学科。专科建设逐步完善，医疗技术不断发展,功能神经外科已逐步形成了一个完整的治疗功能神经疾病的体系，设有三个中心、二个病房，即“细胞刀”治疗中心、癫痫治疗中心、精神外科治疗中心；21病室和12病室，共设72个床位。拥有专科人才18人，其中主任医师2名、副主任医师4名、主治医师4名、医师8名，神经电生理医师2名。(数据？)
　　装备了美国FHC微电极“细胞刀”手术系统，Leksel、ASA602、北琪1000立体定向仪三套、德国N-50等射频仪三台、Bio-logic视频脑电图及术中脑电定位手术系统(癫痫刀)、德国菜司NC-4手术显微镜、DSA、蛇牌脑室镜、神经诱发电位仪等国际顶尖的神经外科专用设备。
　　该科具建立以来，培训了专门人才15人，引进“细胞刀”开展帕金森病治疗已800余例，症状改善率达99.0%；立体定向手术治疗难治性精神病600余例，近期有效率90%；采用杏仁核、海马切除，颞前叶切除、胼骶体切开、癫痫灶切除、皮层热灶等手术方法，治愈难治性癫痫300余例；徒手定向穿刺半月节治疗三叉神经痛200余例，有效率98%，显微血管减压治疗三叉神经痛、舌咽神经痛、面肌痉挛100余例，均取得良好的效果。帕金森病等运动障碍病的细胞刀治疗、难治性精神病的外科治疗、难治性癫痫的外科治疗、微血管减压治疗颅神经综合征、射频治疗三叉神经痛等治疗技术得到了巩固和发展。同时开展了脑起博器植物人促醒治疗，显微血管减压术治疗偏头痛，脑室镜手术治疗颅内疾病等国内外先进技术。
　　今后一段时间内，该科将加强人才建设，鼓励在职培训，引进高素质、高学历人才， 引进专科名医；加强学术建设，开展继续教育项目，举办全省乃至全国的功能神经外科学术会议；编写《功能神经外科诊疗手册》；争取成立湖南省功能神经外科专业委员会(学组)，促进湖南省功能神经外科的发展；从人才﹑技术﹑科研等方面着手,把专科作大作强作出特色；开展神经干细胞移植治疗帕金森等运动障碍病，并成立植物人促醒中心,开展植物人的治疗和促醒研究工作。
　　业务范围主要是脑部病变、神经功能障碍导致的各种运动障碍疾病。该科是神经科与精神科交叉的学科，在省内较早、较规范开展脑立体定向微创手术。该科医务人员由优秀的神经外科、神经内科、精神科医生组成，对脑肿瘤、癫痫、脑出血、脑梗塞、脑外伤等脑部病变引起的精神障碍或脾气性格改变,进行微创手术及康复治疗。